液質(zhì)聯(lián)用與氣質(zhì)聯(lián)用類似，也是由兩部分組成，只是它的分離系統(tǒng)由氣相色譜改成了液相色譜，因此在應(yīng)用方面有所不同。液質(zhì)聯(lián)用LC-MS以液相色譜作為分離系統(tǒng)，質(zhì)譜為檢測系統(tǒng)。樣品在質(zhì)譜部分和流動相分離，被離子化后，經(jīng)質(zhì)譜的質(zhì)量分析器將離子碎片按荷質(zhì)比分開，經(jīng)檢測器得到質(zhì)譜圖。液質(zhì)聯(lián)用LC-MS體現(xiàn)了色譜和質(zhì)譜優(yōu)勢的互補(bǔ)，將色譜對復(fù)雜樣品的高分離能力，與MS具有高選擇性、高靈敏度及能夠提供相對分子質(zhì)量與結(jié)構(gòu)信息的優(yōu)點(diǎn)結(jié)合起來，在藥物分析、食品分析和環(huán)境分析等許多領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用

LC-MS主要用于不揮發(fā)性化合物、極性化合物、熱不穩(wěn)定化合物、大分子量（包括：蛋白、多肽、多聚物等）化合物等的分析測定，且沒有商品化的譜庫可以對比查詢，只能自己建庫或者自己解析譜圖。

一，LC-MS液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)分類：

1，從質(zhì)譜的離子源角度來劃分，包括：電噴霧離子源（ESI），大氣壓化學(xué)電離源（APCI），大氣壓光電離源（APPI）和基質(zhì)輔助激光解吸電離源（MALDI）等；

2，從質(zhì)譜的質(zhì)量分析器角度來劃分，包括四極桿、離子阱、飛行時(shí)間（TOF）和傅立葉變換質(zhì)譜等。ESI、APCI和APPI三種離子源大多與四極桿和離子阱質(zhì)譜聯(lián)用，是目前應(yīng)用最廣泛的幾種液質(zhì)聯(lián)用儀。

二，LC-MS液質(zhì)聯(lián)用主要分析特點(diǎn)：

LC-MS除了可以分析氣相色譜一質(zhì)譜(GC-MS)所不能分析的強(qiáng)極性、難揮發(fā)、熱不穩(wěn)定性的化合物之外，還具有以下幾個(gè)方面的優(yōu)點(diǎn)：

①分析范圍廣，MS幾乎可以檢測所有的化合物，比較容易地解決了分析熱不穩(wěn)定化合物的難題；

②分離能力強(qiáng)，即使被分析混合物在色譜上沒有完全分離開，但通過MS的特征離子質(zhì)量色譜圖也能分別給出它們各自的色譜圖來進(jìn)行定性定量；

③定性分析結(jié)果可靠，可以同時(shí)給出每一個(gè)組分的分子量和豐富的結(jié)構(gòu)信息；

④檢測限低，MS具備高靈敏度，通過選擇離子(SIM)檢測方式，其檢測能力還可以提高一個(gè)數(shù)量級以上；

⑤分析時(shí)間快，LC-MS使用的液相色譜柱為窄徑柱，縮短了分析時(shí)間，提高了分離效果；

⑥自動化程度高，LC-MS具有高度的自動化。